Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8356J3QPD3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm8356J3QPD3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm8356J3QPD3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms