Protein–RNA interactions for Protein: G5E845

Kcnk16, MCG5959, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk16G5E845 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnk16G5E845 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnk16G5E845 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnk16G5E845 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnk16G5E845 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnk16G5E845 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnk16G5E845 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnk16G5E845 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnk16G5E845 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnk16G5E845 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnk16G5E845 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnk16G5E845 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnk16G5E845 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnk16G5E845 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnk16G5E845 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcnk16G5E845 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnk16G5E845 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms