Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-99F6XWB2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms