Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf165E9QAU8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf165E9QAU8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf165E9QAU8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf165E9QAU8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf165E9QAU8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms