Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf4E9QAP7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf4E9QAP7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Taf4E9QAP7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Taf4E9QAP7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms