Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ccdc141E9Q8Q6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ccdc141E9Q8Q6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc141E9Q8Q6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc141E9Q8Q6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc141E9Q8Q6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc141E9Q8Q6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc141E9Q8Q6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ccdc141E9Q8Q6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ccdc141E9Q8Q6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ccdc141E9Q8Q6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccdc141E9Q8Q6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ccdc141E9Q8Q6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc141E9Q8Q6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ccdc141E9Q8Q6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ccdc141E9Q8Q6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc141E9Q8Q6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc141E9Q8Q6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccdc141E9Q8Q6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc141E9Q8Q6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc141E9Q8Q6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ccdc141E9Q8Q6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc141E9Q8Q6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc141E9Q8Q6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc141E9Q8Q6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc141E9Q8Q6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc141E9Q8Q6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc141E9Q8Q6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc141E9Q8Q6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc141E9Q8Q6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc141E9Q8Q6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ccdc141E9Q8Q6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc141E9Q8Q6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc141E9Q8Q6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc141E9Q8Q6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms