Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vmn2r35E9Q7U8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r35E9Q7U8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r35E9Q7U8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms