Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm9972E9Q053 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm9972E9Q053 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm9972E9Q053 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm9972E9Q053 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm9972E9Q053 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9972E9Q053 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm9972E9Q053 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms