Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn24D3YXJ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cldn24D3YXJ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms