Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip3B9EHT4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip3B9EHT4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip3B9EHT4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip3B9EHT4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip3B9EHT4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms