Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc22a28B2RT89 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a28B2RT89 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a28B2RT89 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms