Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud4B2RRE7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud4B2RRE7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud4B2RRE7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud4B2RRE7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud4B2RRE7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud4B2RRE7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms