Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l1A2A259 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkd2l1A2A259 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2l1A2A259 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l1A2A259 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms