Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KLF9Q13886 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KLF9Q13886 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KLF9Q13886 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KLF9Q13886 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KLF9Q13886 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KLF9Q13886 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KLF9Q13886 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KLF9Q13886 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KLF9Q13886 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KLF9Q13886 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KLF9Q13886 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.8 ms