Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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