Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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