Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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