Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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PTPN13Q12923 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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