Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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