Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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