Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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