Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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PTPRTO14522 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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PTPRTO14522 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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PTPRTO14522 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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PTPRTO14522 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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