Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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