Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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PTPN13Q12923 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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PTPN13Q12923 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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PTPN13Q12923 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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PTPN13Q12923 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PTPN13Q12923 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
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