Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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PTPRTO14522 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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PTPRTO14522 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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