Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRTO14522 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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