Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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PTPRTO14522 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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PTPRTO14522 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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PTPRTO14522 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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PTPRTO14522 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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PTPRTO14522 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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PTPRTO14522 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRTO14522 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRTO14522 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRTO14522 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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