Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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