Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gadd45gip1Q9CR59 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms