Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.6 ms