Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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