Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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