Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms