Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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