Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Arcn1Q5XJY5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Arcn1Q5XJY5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Arcn1Q5XJY5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Arcn1Q5XJY5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Arcn1Q5XJY5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Arcn1Q5XJY5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Arcn1Q5XJY5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arcn1Q5XJY5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms