Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms