Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFLP07196 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFLP07196 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFLP07196 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFLP07196 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 651.3 ms