Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb1bp2Q9R000 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1bp2Q9R000 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms