Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tor1aQ9ER39 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms