Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms