Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MitfQ08874 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms