Protein–RNA interactions for Protein: P51683

Ccr2, C-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr2P51683 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr2P51683 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr2P51683 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr2P51683 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr2P51683 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr2P51683 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr2P51683 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr2P51683 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr2P51683 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr2P51683 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr2P51683 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr2P51683 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr2P51683 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr2P51683 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr2P51683 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr2P51683 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr2P51683 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr2P51683 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr2P51683 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr2P51683 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr2P51683 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr2P51683 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr2P51683 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr2P51683 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr2P51683 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr2P51683 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr2P51683 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr2P51683 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr2P51683 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr2P51683 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr2P51683 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms