Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms