Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tor1aQ9ER39 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tor1aQ9ER39 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tor1aQ9ER39 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms