Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms