Protein–RNA interactions for Protein: V9GWY0

Gm15013, 40S ribosomal protein S4, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15013V9GWY0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm15013V9GWY0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm15013V9GWY0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm15013V9GWY0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm15013V9GWY0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm15013V9GWY0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms