Protein–RNA interactions for Protein: V9GWY0

Gm15013, 40S ribosomal protein S4, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15013V9GWY0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm15013V9GWY0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm15013V9GWY0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm15013V9GWY0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm15013V9GWY0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm15013V9GWY0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm15013V9GWY0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm15013V9GWY0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm15013V9GWY0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm15013V9GWY0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm15013V9GWY0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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