Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn8Q9Z260 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn8Q9Z260 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn8Q9Z260 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn8Q9Z260 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn8Q9Z260 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn8Q9Z260 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn8Q9Z260 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn8Q9Z260 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn8Q9Z260 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn8Q9Z260 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn8Q9Z260 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn8Q9Z260 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn8Q9Z260 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn8Q9Z260 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn8Q9Z260 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn8Q9Z260 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn8Q9Z260 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn8Q9Z260 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn8Q9Z260 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn8Q9Z260 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn8Q9Z260 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn8Q9Z260 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn8Q9Z260 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn8Q9Z260 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn8Q9Z260 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn8Q9Z260 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn8Q9Z260 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn8Q9Z260 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn8Q9Z260 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms