Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cited4Q9WUL8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cited4Q9WUL8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cited4Q9WUL8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms