Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdh13Q9WTR5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh13Q9WTR5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh13Q9WTR5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms