Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A1

Clcn2, Chloride channel protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn2Q9R0A1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn2Q9R0A1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn2Q9R0A1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn2Q9R0A1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn2Q9R0A1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn2Q9R0A1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn2Q9R0A1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn2Q9R0A1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn2Q9R0A1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn2Q9R0A1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn2Q9R0A1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn2Q9R0A1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn2Q9R0A1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn2Q9R0A1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn2Q9R0A1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn2Q9R0A1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clcn2Q9R0A1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clcn2Q9R0A1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn2Q9R0A1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn2Q9R0A1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn2Q9R0A1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms